大豆菌核病由核盘菌引起。在病源菌充足的条件下，田间湿度成为影响发病的主要因素，高湿利于菌核病的发生，干旱少雨则发病轻。据对重迎茬大豆菌核病发病率调查：当前茬为油菜的大豆田，菌核病发病率比正常轮作大豆田高出20—50%。
