芝麻病害主要是芝麻茎点枯病、枯萎病和病毒病以及叶斑病等。危害芝麻的虫害有地下虫、蚜虫和蛀蒴害虫。
中国芝麻病害的种类达30种之多，其中以茎点枯病、枯萎病、青枯病、立枯病、疫病、病毒病、叶斑病等危害较重而普遍。危害中国芝麻的主要害虫有小地老虎、蚜虫、甜菜夜蛾、芝麻天蛾、盲蝽等。
