玉米缺磷时，嫩株敏感，植株矮化，叶尖、叶缘失绿呈紫红色，后叶端枯死或变成暗紫褐色。紫色是因玉米植株体内糖代谢受阻，叶中积累糖分较多，促进花色素苷的形成，使植株带紫色。苗期缺磷，茎和叶片暗绿带紫红色，从下部叶片开始，先是叶尖干枯，沿叶缘向基部蔓延，进而呈暗褐色，以后逐渐向幼嫩叶片发展。根系发育不良，茎部衰弱，细长。孕穗至开花期缺磷，糖代谢与蛋白质合成受阻，雌穗减少，分化发育不良，花丝延迟抽出，授粉受阻，使受精不良，籽粒不充实，甚至空穗。果穗卷曲，穗顶缢缩，会出现秃顶、缺粒与粒行不整齐现象。随着生长，下部叶片由紫红色变成黄色。抽穗吐丝延迟。缺磷影响玉米授粉和子粒灌浆，玉米果穗小，秃尖，易弯曲，行列不整齐，子粒也不饱满，成熟期推迟。