选用抗锈病的蒜种，如紫皮蒜、小石口大蒜、舒城蒜等，并清洁好土壤进行科学种植。避免葱蒜混种，注意清洁田园以减少初侵染源。适时晚播，合理施肥，减少灌水次数，杜绝大水漫灌。遇有降雨多的年份，早春要及时检查发病中心，喷药预防。
发病初期，可选用15%三唑酮可湿性粉剂1500倍液、20%三唑酮乳油2000倍液、97%敌锈钠可湿性粉剂300倍液、25%敌力脱乳油3000倍液、25%敌力脱乳油4000倍液加15%三唑酮可湿性粉剂2000倍液、70%代森锰锌可湿性粉剂1000倍液加15%三唑酮可湿性粉剂2000倍液进行防治。施药间隔10至15天，连续防治1至2次即可。此外，可实施健身栽培如施用硅肥，或使用苯醚甲环唑进行防治。
应选用抗病品种，实施合理轮作，并加强栽培管理。