草莓根腐病主要侵害根部，常见有急性萎蔫性和慢性萎缩型两种。急性萎蔫性多在春、夏两季发生，特别是久雨初晴后叶尖突然调萎，不久呈青枯状，引起全株枯死。慢性萎缩型在定植后至冬初均可发生，呈矮化萎缩状，下部老叶叶缘变紫红色或紫褐色，逐渐向上扩展，全株萎蔫或枯死。检视根部可见根系开始都由嫩根先端或中部开始变成褐色或黑色而腐烂，然后中柱变红褐腐朽，继而扩展至根茎，病株易拔起。
发病时由细小侧根或新生根开始，初出现浅红色褐色不规则的斑块，颜色逐渐变深呈暗褐色。随病害发展，所有根系迅速坏死变褐。草莓根腐病植株根系比健康植株根系短小，颜色灰暗，地下部不定根大量死亡，新生根受到病原菌的侵害，生长稀疏。根部受害，吸收能力下降，又导致水分、无机物和营养物质不能正常输送，致使地上部弱小或整株青枯。
发病初期喷洒60%琥·乙膦铝可湿性粉剂500倍液或70%乙·锰可湿性粉剂500倍液、58%甲霜灵·锰锌500倍液、64%杀毒矾M8可湿性粉剂500倍液、72.2%普力克水剂800倍液，隔7～10天1次，连续防治2～3次。