在阴雨天气、苗床或棚室温度高、施用未腐熟肥料、土壤湿度大、通风透光条件差的情况下，易发生茎基腐病。冬春茬日光温室番茄的定植期一般在9月中、下旬，时值秋雨绵绵，气温偏高，如栽植时茎基部皮层受伤、栽植过深、土壤湿度偏大、连阴天持续时间较长且放风排湿不及时，会造成番茄茎基腐病的发生和流行。茄病镰孢以菌丝体和厚垣孢子随病残体在土壤中越冬，湿度大时病菌从伤口侵入，引起发病。后者以子囊壳或分生孢子器在病部或病落叶上越冬，条件适宜时产生孢子借风雨传播进行初侵染和多次再侵染，致病害不断扩展。雨日多、湿气滞留易发病。