潜叶蛾最喜危害新抽发的嫩枝嫩叶，幼虫潜钻入表皮下取食叶肉，形成弯曲的虫道，并在隧道里排泄粪便。被害叶片卷曲硬化，容易脱落，严重时造成大量落叶或引发溃疡等病害，影响柑橘正常生长。幼虫主要在柑橘嫩枝、嫩叶表皮下迂回蛀食，有时也会钻食幼果表皮。
防治措施包括农业防治和药剂防治。农业防治方面，结合栽培管理措施进行抹芽控制夏梢和早发秋梢或夏剪，以抑制虫源。通过水肥管理，使夏、秋梢抽发健壮整齐，减少着卵量，中断幼虫食物来源。冬季结合修剪，剪除被害梢，减少越冬虫口基数，并将摘下的嫩梢、虫叶和剪下的被害枝梢集中处理，直接消灭害虫。
药剂防治方面，重点保护夏、秋梢。一般在新梢萌发不超过3毫米或嫩芽被害率达5%左右时开始喷药，每隔7天左右喷1次，连续2～3次。防治成虫宜在傍晚喷药，防治初孵幼虫宜在晴天午后用药。常用药剂有25%西维因可湿性粉剂600～800倍液和25%杀虫双水剂600～800倍液。