小麦赤霉病原则上以防为主，主动出击，见花打药，足液喷雾。对已发生的可选择对路农药如甲基托布津、吡唑*氟环唑防治。
小麦赤霉病主要是预防为主，在小麦齐穗至扬花期，视天气情况喷施丙硫菌唑等杀菌剂1一3次。
防治小麦赤霉病要用抗病能力好的品种，种植的时候还要进行拌种，可以预防小麦发病。在种植时要提前做好深耕工作，这样能够减少病菌的来源。在小麦扬花之前要做好预防工作，可以起到防治药物的有多菌灵、戊唑醇等杀菌的药剂，用药一般是5-7天左右一。
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