水稻纹枯病的防治方法包括农业措施和化学防治。农业防治方面，首先应打捞菌核，减少菌源，每季大面积打捞并带出田外深埋。其次，加强栽培管理，施足基肥，追肥早施，不可偏施氮肥，增施磷钾肥，采用配方施肥技术，使水稻前期不披叶，中期不徒长，后期不贪青。灌水做到分蘖浅水、够苗露田、晒田促根、肥田重晒、瘦田轻晒、长穗湿润、不早断水、防止早衰，要掌握“前浅、中晒、后湿润”的原则。选用良种，根据保山市各稻区的生产特点，在注重高产、优质、抗病的基础上，选用适合当地种植的抗纹枯病品种，以降低田间荫蔽作用、增加通透性及降低空气相对湿度、提高稻株抗病能力。合理密植，水稻纹枯病发生的程度与水稻群体的大小关系密切；群体越大，发病越重。化学防治方面，可用井冈山素、苯甲嘧菌酯、井腊芽、戊唑醇、苯甲丙环唑等药剂进行防治，封行期、破口期各施药一次。