研究结果表明，苹果苦痘病主要与果实中钙含量不足及氮钙比例失调密切相关。优质果实的钙含量应高于1.1毫克/克，总氮含量应为10-14毫克/克。钙低氮高易诱发苦痘病，而氮钙比大于10的果实更易发病。
防治苹果苦痘病的关键措施包括调降酶活性、维持适宜的钙氮比例与钙含量。在生长季节，尤其是果实发育期，应适量施用钙肥以补充钙元素，确保果实钙含量达标。同时，合理控制氮肥施用量，避免过量施用富含氨态氮的肥料，如碳铵和氨水。
为保持树势中等或生长发育均衡，需注重施肥管理。一是增施有机肥或农家肥，如义信专用生态肥、沼气肥等，并配合叶面喷施氨基酸钙、乳酸钙等。二是科学施用氮肥，防止偏施和晚施，减少果实病害。此外，加强水分管理，注意雨季排水，合理控制灌溉量，防止过量氨态氮积累，从而降低苦痘病的发生风险。