大豆黑斑病主要为害叶片和豆荚。叶片染病，病斑不规则形，直径5～10mm，褐色，具同心轮纹，上生黑霉，即病原菌分生孢子梗和分生孢子。荚上生圆形或不规则形黑斑，其上密生黑色霉菌，荚皮破裂后侵染豆粒。病斑圆形至不规则形，暗褐色，四周略隆起，湿度大时病斑表面密生黑色霉层。病叶边缘稍隆起，反卷干枯，病斑可汇合成大斑块，破裂脱落。带病种子长出的幼苗，子叶上现半圆形深褐色凹陷斑，天旱时病情扩展缓慢，低温多雨时，病害扩展到生长点，病苗枯死。成株叶片染病初现褪绿小圆斑，后逐渐形成中间灰色至灰褐色，四周褐色的蛙眼斑，大小2～5mm，有的病斑呈椭圆或不规则形，湿度大时，叶背面病斑中间生出密集的灰色霉层，发病重的病斑布满整个叶片，融合或致病叶干枯。茎部染病产生椭圆形病斑，中央褐色，边缘红褐色，密布微细黑点。荚上病斑圆形或椭圆形，中央灰色，边缘红褐色。豆粒上病斑圆形或不规则形，边缘暗褐色，中央灰白，病斑上霉层不明显。