发病时根茎部位会慢慢腐烂，多由于根茎出现伤口并被水长期浸泡引起。西葫芦茎腐病病菌从采瓜、打叶的伤口中传播，初期伤口出现胶质物后感染腐烂，病处变褐色，最后腐烂枯死。发病初期，根茎部出现水浸状病斑，病部逐渐缢缩，茎内维管束变成褐色，但不向上发展，侧根无明显病症，而叶片表现出新叶叶缘变褐色并逐渐枯焦，叶片逐渐变黄；后期病部变糟，留下丝状褐色维管束，整株萎蔫而枯死。高湿时，病部出现白色（或粉色）霉层。西葫芦在整个结瓜期均易发生该病，受浸染的部位主要是根茎部。
