小麦条锈病是典型的活体寄生、气流传播病害，主要由小麦条锈病菌以夏孢子在小麦上完成周年的侵染循环，转主寄主为小檗。其侵染循环可分为越夏、侵染秋苗、越冬及春季流行四个环节。小麦条锈菌在中国甘肃的陇东、陇南、青海东部、四川西北部等地夏季最热月份旬均温在20℃以下的地区越夏。秋季越夏的菌源随气流传播到中国冬麦区后，遇有适宜的温湿度条件即可侵染冬麦秋苗，秋苗的发病开始多在冬小麦播后1个月左右。秋苗发病迟早及多少，与菌源距离和播期早晚有关，距越夏菌源近、播种早则发病重。当平均气温降至1～2℃时，条锈菌开始进入越冬阶段。一月份平均气温低于-6～-7℃的德州、石家庄、介休一线以北，病菌不能越冬，而这一线以南地区，冬季最冷月均温不低于上述温度的四川、云南、湖北、河南信阳、陕西关中、安康等地则可以菌丝状态在病叶里越冬，成为当地及邻近麦区春季流行的重要菌源基地。