夏秋高温季节是保护地蔬菜栽培的难点。此期由于气温高，昼夜温差小，夜温高，作物同化作用产生的营养物质被大量消耗，造成植株瘦弱，营养不良。同时由于大部分蔬菜根系不发达，吸收能力差，对不平衡施肥适应能力差，易出现各种生理病害，致使蔬菜品质低劣，产量不高。
最常见的问题是卵菌病害，如腐霉和疫霉引起的霜霉病、疫病、绵疫病和晚疫病等。这些病害能严重危害瓜类、番茄、甜椒和茄子，造成巨大损失。
在栽培管理上，要采取一系列措施：首先，选择抗病品种，这是防治病害最经济有效的方法。其次，清理病残体，减少田间菌源。采用高畦栽培，地膜覆盖，避免大水漫灌等措施，以降低田间湿度。覆盖遮阳网可降低温度，提高植株抗性。在高温多雨季节可喷洒保护剂，如波尔多液、代森锰锌等。化学防治方面，可选用多抗霉素、灭霉灵等农药。
夏季高温多雨，作物易发生徒长，可喷施500倍矮壮素或1000倍促花王3号，抑制旺长，促进花芽分化。对长势偏弱的作物可喷施叶面肥，如300倍尿素加300倍磷酸二氢钾混合液，或喷施高氮、高钾类冲施肥。
此外，要防好病虫害，特别是白粉虱、蚜虫等，可用吡虫啉、啶虫脒等药剂防治。喷药时结合新高脂膜和壮瓜蒂灵，能提高药效，促进果实发育。