发病初期，可用33.5%必绿二号（八羟基喹啉铜）1500〜2000倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1000~1500倍液，或20%甲基立枯磷乳油800〜1000倍液，或15%恶霉灵水剂1000~1500倍液灌根，每株200毫升，隔7~10天灌1次，连续3~4次。
茄子枯萎病防治方法：1、种子及苗床消毒，播前用55℃温水浸种15分钟，进行床土消毒。积极防治地下害虫，避免根系出现伤口。2、与非茄科蔬菜实行3年以上轮作，用赤茄、托鲁巴姆等作砧木进行嫁接育苗，适时、精细定植，适量控制浇水，加强中耕，促进根部伤口愈合。3、发病初期可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或50%苯菌灵可湿性粉剂1000倍液，或20%甲基立枯磷乳油1000倍液，或5%菌毒清水剂400倍液，或15%恶霉灵水剂1000倍液灌根，每株200毫升。
合理轮作换茬、嫁接是防治茄子枯萎病的好方法。加强肥水等田间管理，使用多菌灵、福美双等药剂防治也是有效措施。