油菜菌核病在油菜整个生长阶段都可能发生，结实期发病率更高。中国南方地区冬季播种油菜，一般在10-12月份会发生少数菌核病，而绝大多数是在第2年的3-4月份发病比较严重。初期防治时间是播种以及菌核病发生早期阶段，此时施用生物菌剂可有效降低田间菌核数量，而防治的重要阶段是始花期和盛花期。油菜初花到盛花期防治，感病品种应在第一次施药后一星期左右防第二次。春暖花开的阳春四月尤其适合菌核病防治工作。油菜菌核病应该在油菜初花期和盛花期各防治一次，一是在3月上旬子襄盘萌发盛期，二是在4月上中旬油菜盛花期。如发现病株应及时清除，并根据植保要求喷施40%菌核净可湿性粉剂1000倍液、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液等针对性药剂防治。