苗期至成株期均可发病，以距地面5-30厘米发病最多。瓜被害脐部形成水浸状病斑，软腐，表面长满棉絮状菌丝体。茎部被害，开始产生退色水浸状病斑，逐渐扩大呈淡褐色，病茎软腐；长出白色棉絮状菌丝体，茎表皮和髓腔内形成坚硬菌核，植株枯萎。幼苗发病时在近地面幼茎基部出现水浸状病斑，很快病斑绕茎一周，幼苗猝倒。一定湿度和温度下，病部先生成白色菌核，老熟后为黑色鼠粪状颗粒。主要危害茎基部和果实，也能危害茎蔓和叶。茎染病，发病部位主要在茎基部和茎分杈处，发病初始产生水浸状斑，扩大后呈淡褐色，病茎软腐纵裂，病部以上茎蔓和叶凋萎枯死。湿度高时病部长出一层白色棉絮状菌丝体，受害后茎秆内髓部受破坏，发病末期腐烂而中空，剥开可见白色菌丝体和黑色菌核。菌核鼠粪状。