大豆锈病是由夏孢子侵染大豆而造成危害，主要发生在叶片、叶柄和茎，严重者影响到全株，受侵染叶片变黄脱落，形成瘪荚。在发病初期，大豆叶片出现灰褐色小点，以后病菌侵人叶组织，形成夏孢子堆，叶片出现褐色小斑，夏孢子堆成熟时，病斑隆起，呈红褐色、紫褐及黑褐色。病斑表皮破裂后由夏孢子堆散发出很多锈色夏孢子。在温、湿度适于发病时，夏孢子可多次再侵染。发病后期可产生冬孢子堆，内聚生冬孢子，冬孢子堆表皮不破裂，不产生孢子粉。整个生育期均可发病，主要侵染叶片、叶柄、茎秆，其中以叶片为害最重。发病初期叶片上出现褐色小点，以后病斑逐渐扩大，呈黄褐色，红褐色，紫褐色或黑褐色小斑，病部渐隆起，形成夏孢子堆，单个病斑约1mm左右，病斑密集时，形成被叶脉限制的坏死斑。