该病危害鳞茎，田间鳞茎膨大期，在1∼2片外叶的下部，一般在假茎抽长期开始发病，先从脚叶的叶缘或中脉发病，初期在基部近地面处出现水渍状病斑，形成黄白色条斑，可贯穿整个叶片，温度高时，病部呈黄褐色软腐状，后逐渐向上部叶片扩展，进而外叶折披、软化腐烂，致全株枯黄。病害症状为大葱地上部分倒伏，容易拔起，茎下部腐烂，引起全株倒伏，并有恶臭。该病的病原菌为唐菖蒲假单胞菌大葱致病变种(大葱球茎软腐病假单胞菌)，为胡萝卜软腐欧氏杆菌，属细菌类。病菌在病残体和土壤中腐生，是田间的主要侵染源，一般种子不带菌。软腐病在大葱生长后期，植株外部的1～2张叶片基部产生半透明灰白色斑，叶鞘基部软化腐烂，致使外叶折倒，并继续向内扩展，致使整株呈水浸状软腐，并伴有恶臭。