病原菌主要以菌丝体在田间病株及病残体上越冬，病残体腐烂分解后病原菌随之死亡。病健根接触及病残体移动是病害传播的主要方式。当病健根接触或健根与病残体接触时，病原菌即可通过伤口直接侵入，并迅速扩展危害。根朽病多发生在由旧林地或河滩地改建的果园中，前作没有种过树的果园很少发病。
