玉米柄锈菌以冬孢子随病株残余组织遗留在田间越冬。入春后当环境条件适宜时冬孢子即可萌发并产生担孢子，借气流传播到寄主作物，由叶面气孔直接侵入，引起初次侵染。田间少量植株发病后，在病部产生锈孢子，形成夏孢子堆并散发出夏孢子，夏孢子借气流传播进行再侵染，在植株间扩散蔓延，加重危害;直到秋季，产生冬孢子堆和冬孢子。发病初开始喷洒75％百菌清可湿性粉剂600倍液，或64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液，50％唬胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液，60%琥·乙麟铝可湿性粉剂500倍液，隔7-10天1次，连续防治3-4次。