主要通过种子、病残体在土壤中越冬，借助雨水、水流、气流、昆虫和农事操作传播。以菌丝体或分生孢子丛在土壤中的病残体上越冬，翌年以分生孢子进行初侵染和再侵染，借气流传播蔓延。温暖高湿、偏施氮肥或连作地发病重。丝瓜褐斑病病菌随病残体在土壤中越冬，借风、雨传播，分生孢子发芽后从气孔侵入。发病后，病斑上产生分生孢子传播出去，引起再侵染，病害在田间迅速扩展蔓延。病菌喜温暖、高湿条件，温度23～25℃，相对湿度85%以上是病害发生的适宜条件。
