以菌丝体或厚垣孢子随病残体留在土壤中越冬，成为初侵染源。厚垣孢子在土中可存活5-10年，萌发后先长芽管，从根部伤口或根冠细胞间隙侵入，地上部重复侵染主要靠灌溉水；地下部当年很少重复侵染。种子带菌和带有病残体的有机肥，是无病区的初侵染源。真菌引起的病害，病菌随病残体在土壤中越冬，种子带菌，从根部伤口或根冠侵入。土壤干旱、重茬、根结线虫、地下害虫多发病重。尖镰孢菌冬瓜专化型，属半知菌类真菌。该型强侵染冬瓜和西瓜，弱侵染瓠瓜、甜瓜、黄瓜。病菌以菌丝体在种子内或以厚垣孢子随病残体在土壤中、有机肥中越冬，是下一年的初侵染源。第二年当温湿度适宜时，病菌萌发长出芽管，从根部侵入，引起寄主发病，借灌溉水传播，进行重复再侵染。