玉米缺磷在苗期表现最为明显，植株生长缓慢、瘦弱，茎基部、叶鞘甚至全株呈现紫红色，叶尖和叶缘出现黄色，严重时叶尖枯萎呈褐色。幼嫩植株表现尤为严重。随着生长，下部叶片由紫红色变成黄色。抽穗吐丝延迟。缺磷影响玉米授粉和子粒灌浆，玉米果穗小，秃尖，易弯曲，行列不整齐，子粒也不饱满，成熟期推迟。苗期缺磷，根系发育差，苗期生长缓慢。5叶期后明显出现缺磷症状，叶片呈紫红色，叶尖紫色，叶缘卷曲，这是由于碳元素代谢在缺磷时受到破坏，糖分在叶中积累，形成花青素的结果。缺磷还使花丝抽出速度缓慢，影响授粉，并且果穗卷缩，穗行不齐，籽粒不饱满，常出现秃顶现象，成熟延迟。玉米从发芽至三叶期前，如果此期磷素不足，下部叶片便开始出现暗绿色，此后从边缘开始出现紫红色；极端缺磷时，叶边缘从叶尖开始变成褐色。此后生长，如果此时缺磷，雌蕊花丝延迟抽出，植株受精不完全，往往就会生长出籽实行列歪曲的畸形果穗。