以菌丝体或厚垣孢子随病残体留在土壤中越冬，成为初侵染源。厚垣孢子在土中可存活5-10年，萌发后先长芽管，从根部伤口或根冠细胞间隙侵入，地上部重复侵染主要靠灌溉水；地下部当年很少重复侵染。种子带菌和带有病残体的有机肥，是无病区的初侵染源。在带菌土上培育的丝瓜或节瓜苗发病重；土温15℃以上始发，20-30℃盛发；土壤过分干旱、重茬、根结线虫及地下害虫为害发病重。以菌丝体或分生孢子器随病残体存活于土壤中，以分生孢子侵入，借雨水溅射传播蔓延。温暖多湿天气有利于发病，偏施氮肥发病重。蔓枯病的病菌会以分生孢子或是菌丝体的形式在田间的土壤或者病残体上进行越冬。这些菌丝体将成为第二年田间的初侵染源。初侵染源可依靠雨水、农事操作等进行传播。该病菌属子囊菌亚门真菌。主要以分生孢子器或子囊壳随病残体在土中或架材上越冬。翌年靠灌溉水、雨水传播。从伤口、自然孔侵入，种子也可带菌，引起子叶发病。重茬地、植株密度大、通风透光差、生长势弱发病重。气温为18~25℃，相对湿度在85%以上时易发病。