病菌的芽管和菌丝体与幼苗接触，从裂口或幼嫩部位侵入，引起玉米苗枯的病原主要是串珠镰刀菌。地势低洼、贫瘠、盐碱、播种过深、土壤积水均能引发苗枯。种子带菌的感染率为4.3%～98.3%，平均75.3%。串珠镰孢菌存在于玉米种皮、胚、胚乳组织内，种子带菌率高会导致玉米出土率、幼苗株高、生长速率及产量呈负相关。通过组织切片和选择性培养基观察，该菌系统性地由受感染种子扩展到幼苗组织内，引致苗枯病发生。生产上播种过早或地势低洼，播种后遇长期低温高湿环境易发病。
