谷子常见的虫害有粟灰螟、粟茎蝇、粘虫、栗茎跳甲、粟缘蝽、蓟马及蚜虫等。斑潜蝇成虫体长1.3~2.3毫米,淡灰黑色;卵产在植物叶片内;幼虫乳白至金黄色,蛆状,最长可达3毫米。主要以幼虫钻蛀叶片为害作物,形成弯曲隧道状蛀道,蛀道多为白色,后期变为铁锈色,严重时叶片在短期内被钻花干枯。谷子的主要病害有谷子白发病、谷子锈病、谷瘟病、谷子叶斑病、纹枯病及谷子褐条病等。