洋葱紫斑病主要为害叶片和花梗，初期呈水渍状白色小点，后期变淡褐色圆形或纺锤形稍凹陷斑，延续扩展呈褐色或暗紫色，周围有黄色晕圈。
病部长出深褐色或黑灰色具同心纶纹状排列的霉状物，病部软化易折断。种株花梗发病率高，致使种子皱缩，不能充分成熟，收获前还会损害鳞茎导致糜烂。
南方地区多以分生孢子在葱类作物上辗转危害。北方寒冷地区以菌丝体在寄主体内或病残体上越冬后，产生分生孢子，借气流、雨水传播，经气孔、伤口侵入。发病条件为温暖多湿，低于12℃则不发病。葱蓟马刺吸的伤口是病菌侵入的门户，故此，蓟马严重发生的地段，此病也较重。
病菌随发病寄主越冬或越夏，也可以菌丝体和菌核在田间病残体上与土壤中越夏或越冬，成为侵染下一季寄主植物的主要菌源。在温湿度适合时，越季菌丝体产生分生孢子，分生孢子随风雨传播，接触植物体后，主要由伤口侵入，也可直接穿透表皮而侵入。菌核萌发产生菌丝体直接侵入，或产生孢子后再侵入植物。菌核和病株带菌残屑也可混杂在种子间，随种子调运而传播。生长期中病株产生分子孢子随气流、灌溉水和农事操作而分散，引起多次重复侵染。冷凉、高湿的环境条件最有利于灰霉病的发生。18~23℃有利于灰霉菌生长、孢子形成、孢子萌发和发病，但是在低温(0~10℃)下病原菌仍然活跃。
洋葱紫斑病主要危害叶片和花梗，初呈水渍状白点，后变淡褐色凹陷斑，延续变褐色或淡紫色。
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