微生物肥料作为一种新型肥料，具有改善土壤结构、增强土壤肥力、节约土地资源、增加粮食产量、减少化肥用量的优点，是发展绿色农业、生态农业的必然趋势。它对某些农作物具有抑制致病菌的功效，有益菌在根际中迅速繁殖，形成优势种群，减少或抑制根际病原微生物的繁殖，降低作物病害的发生几率。此外，微生物肥料含有高有机质、生物活性菌和丰富营养，能够疏松土壤，增加透气性，减少土壤污染，实现化肥减量增效目标。
