谷子白发病菌在种子、土壤、粪肥上均可携带，环境适宜时发病。病原菌以卵孢子混杂在土壤、粪肥或粘附在种子表面越冬，土壤中可存活2～3年。用病株谷草饲喂牲畜后，粪便中仍有多数存活的卵孢子。土壤带菌是主要越冬菌源，其次是带菌厩肥和带菌种子。谷子发芽时，卵孢子萌芽产生芽管，从胚芽鞘、中胚轴或幼根表皮直接侵入，蔓延到生长点，随生长点分化而系统侵染，进入各层叶片和花序，表现各种症状。谷子芽长3厘米以前最易被侵染。
