先发生于根及地上幼嫩部分，根系生长很差，茎和根尖的分生组织受损，根尖细胞腐烂死亡，植株矮小，呈未老先衰状。幼叶卷曲，叶尖有粘化现象，叶缘发黄，逐渐枯死。定型的新生叶片前端及叶缘枯黄，老叶仍保持绿色，结实少秕粒多。水稻缺钙时，植株主茎中部叶片的叶绿素间或消失，叶片卷曲，最后死亡。新叶顶部卷曲、发白、不久变褐，但下部叶片一般表现正常。
