番茄枯萎病主要在开花结果后发生，被害株最初表现为部分叶片或一侧叶片中午萎蔫下垂，早晚可以恢复。随着病情发展，萎蔫叶片逐渐增多，最终遍及全株，早晚无法复原，并迅速枯死。病株主蔓基部纵裂，维管束变褐。茎基部、节和节间出现黄褐色条斑，常有黄色胶状物流出，潮湿时病部表面产生白色至粉红色霉层。病株易被拔起。
