大豆疫霉根腐病的防治主要包括以下措施：加强检疫，防止疫区扩大，特别是对疫区调出种子的检疫；推广抗病品种，使用抗病或耐病品种以减轻或避免病害发生；加强田间管理，及时排除田间积水，中耕松土，多施有机肥，增加土壤通透性；实行轮作，最好水旱轮作；种子处理；深翻土壤，加速病残体的腐烂分解；深沟高畦栽培，雨停不积水；使用的有机肥要充分腐熟，并不得混有上茬本作物残体及腐烂物；选用抗病、包衣的种子，如未包衣，则用拌种剂或浸种剂灭菌；合理密植，及时去除病枝、病叶、病株，并带出田外烧毁，病穴施药或生石灰；地膜覆盖栽培，可防治土中病菌危害地上部植株；适当增施磷钾肥。