预防土豆根腐病害需注意基肥施用，有机肥如完全腐熟的普通农家肥为宜。施用化肥时应与种薯保持3-5厘米距离，以免影响种薯萌发和出苗。喷施叶面肥应把握时机，上午10点前或下午3点后效果较佳，土豆苗高30公分后喷第一遍，每间隔7天再喷第2遍和第3遍，以提高土豆吸收营养能力和膨大活力，促进发育。出现土豆烂根病害的田间，应及时灌根或冲施微生物菌肥根小子，杀灭土壤中有害菌，增加有机质含量，平衡微生物菌群数量，养护根系。水合霉素与恶霉灵或甲硫与恶霉灵混配，能防治多种作物根部病害。防治马铃薯根腐病的方法包括合理轮作、施肥和密植，播种前药剂拌种，及时排除田间积水，保持通风透光。