防治西瓜最有效的方法是嫁接换根，用葫芦或新土佐等高抗枯萎病的葫芦科作物做砧木嫁接西瓜品种，注意彻底断掉西瓜根，苗子栽植时不使嫁接口部位与土壤接触，可有效防止西瓜枯萎病的发生。
预防措施：将奥力克—青枯立克按600倍液稀释，每平米3升在播种前、播种后及栽前苗床浇灌；在定植时、定植后和预期病害常发期前，按600倍液稀释进行灌根，每7天用药1次，用药次数视病情而定。
治疗方法：按奥力克—青枯立克500倍液稀释使用，病害严重时可适当加大用药量。对病株及病株周围2～3米内植株进行灌根或小面积漫灌；若病原菌同时为害地上部分，应在根部灌药的同时，地上部分进行喷雾，每5天用药1次。