辣椒的病害主要有疫病、炭疽病、病毒病、灰霉病、疮痂病、青枯病等；辣椒的主要虫害有烟青虫、白粉虱、红蜘蛛、蚜虫、棉铃虫、斑潜蝇等。辣椒种植过程中，受到虫害侵害一定要及时进行防治，尤其在虫害发生初期或虫卵期防治效果最佳。对于保护地来说，也可用合适的烟雾剂进行熏烟防治，防治虫害要注意，在辣椒采收前10-15天，应停止用药。
