一般受害叶片上出现圆形或不规则形病斑，直径1～10毫米，褐色或黑褐色，具有同心轮纹。有时也会出现一种小病斑，圆形或近圆形，直径1～3毫米，轮纹不明显，边缘暗褐色，稍隆起，内部淡褐色。
芝麻黑斑病有先在叶片上出现针尖大小的黑色病斑随后病斑逐渐扩大，几个病斑在一起形成不规则的大病斑的典型危害状。
