西红柿炭疽病一般用抗生素和铜制剂田间交替喷雾防治，也可使用嘧菌酯或烯酰吗啉等喷雾防治。具体防治措施如下：
1.番茄种子在播种前用52℃温水浸种30分钟。
2.与非茄果类蔬菜实行3年以上轮作。
3.种植番茄施用充分腐熟有机肥，采用高畦或起垅栽培。
4.及时清除病残果，带出田外集中处理，保护地要避免高温高湿条件出现。
发病初期可选用以下药剂防治：
40%氟啶胺异菌脲悬浮剂750~1000倍液；
10%中生菌素氨基寡糖素可湿性粉剂20~30克/亩；
50%氟醚菌酰胺水分散粒剂+68%精甲霜锰锌水分散粒剂6~9克/亩；
25%溴菌腈可湿性粉剂+45%代森铵水剂200~400倍液；
20%苯醚咪鲜胺微乳剂2500~3000倍液。
生物防治可采用枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、荧光假单胞菌等，注意使用方法和时期。化学防治贯彻“预防为主，综合防治”的方针，药剂可选用甲基硫菌灵、氟硅唑、多福溴菌、咪鲜胺锰盐、苯甲·嘧菌酯、氟菌·肟菌酯、咪鲜胺等。由于炭疽病主要为害果实，最好摘除病果后再打药，若打药后下雨则需补施。
西红柿炭疽病防治以预防为主，结合园艺措施、生态调控、生物防治等措施，并适时科学施用高效低毒低残留农药。在发病期，结合防治番茄主要病害，选广谱性杀菌剂进行兼治，防治适期在座果中期、未着色前开始喷药，用药间隔期7-10天，连续防治2-3次。高效、低毒、低残留防治用药可选戊唑醇、苯醚甲环唑、吡萘·嘧菌酯等喷雾；常规防治用药可选咪鲜胺、多抗霉素、代森锰锌、恶霜·锰锌等喷雾。具体用药量及倍数需根据作物病害危害程度及各农药品种使用说明确定。