（1）实行轮作轮作，施腐熟肥料。（2）采用高畦栽培防止过干和大水漫灌及积水，及时清除病株（特别在灌水前）。（3）药剂防治用敌克松可湿性粉剂灌根，或代森锌可湿性粉剂，或链霉素加多菌灵可湿性粉剂，或新植霉素于发病前或发病初期喷洒，每隔5〜7天喷1次，连喷2〜3次。（4）及时治虫从苗期开始检查，发现地蛆、跳甲、菜青虫、小菜蛾等害虫，应及时防治，减少虫咬伤口即可减少细菌侵入机会，防止虫传病。
发病初期开始喷洒30％氧氯化铜悬浮剂800倍液或47％加瑞农可湿性粉剂1000倍液、77％可杀得可湿性微粒粉剂500倍液、30％绿得保悬浮剂400倍液，14％络氨铜水剂300倍液。
防治莴笋软腐病有合理密植，清沟排渍，清除杂草，合理追施肥料，少施化学氮肥。