采用施保克进行浸种消毒，杀死种子上的病菌。拨除大田中病株。水稻恶苗病应提前进行种子消毒，后期无法自愈。水稻恶苗病在低温或秧苗长势弱的情况下容易发生。预防可以采用药剂浸种育苗，培育壮秧等。如果有发生，可以拔除病株，对未发病的施用叶面肥和矮壮素预防。种子消毒是有效杀灭种子带有的稻瘟病、恶苗病等病菌的关键措施，对减轻秧苗、大田病害发生程度，对减少防治环节。1）25%咪鲜胺2000～3000倍液（即2毫升咪鲜胺兑水5公斤，浸泡4～5公斤种子）；（2）40%强氯精400～500倍液﹝即每小包（10克）40%强氯精兑水4～5公斤，可浸泡消毒4～5公斤种子﹞。水稻恶苗病首先要选择优良品种，二是浸种消毒，三是加强水肥管理。