一是土壤细菌感染。二是病残株所带细菌感染。三是种子传播。
病菌主要以菌核在土壤中及混杂在种子中越冬或越夏，在环境条件适宜时，菌核萌发产生子囊盘，子囊盘散放出的子囊孢子借气流传播蔓延，穿过寄主表皮角质层直接侵入，引起初次侵染。病菌通过病、健株间的接触，进行多次再侵染，加重危害。
茄子菌核病病菌借气流传播蔓延，穿过寄主表皮角质层直接侵入，引起初次侵染。病菌通过病、健株间的接触，进行多次再侵染，加重危害。
病菌主要以菌核在土壤中及混杂在种子中越冬或越夏，在环境条件适宜时，菌核萌发产生子囊盘，子囊盘散放出的子囊孢子借气流传播蔓延，穿过寄主表皮角质层直接侵入，引起初次侵染。病菌通过病、健株间的接触，进行多次再侵染，加重危害。菌核存活适宜干燥的土壤，可成活3年以上，浸在水中约成活1个月。
茄子菌核病属于真菌病害，病菌以菌核在土壤中越冬，也可在种子上越冬。翌春茄子定植后菌核萌发，抽出子囊盘即散发子囊孢子，随气流传播到寄主上，由伤口或自然孔口侵入进行浸染。子囊孢子萌发先侵害植株下部叶片和花瓣，受害花瓣及叶片脱落，菌核本身也可以产生菌丝直接侵人近地面茎叶和果实。温度16°C〜20°C、相对湿度85%〜100%条件下茄子最易发病。
土壤中、种子上越冬，其中土壤中病残体带菌率高，是主要浸染源。土壤中病菌经风雨及灌溉水传播。浸染植株根茎基部和近地面果实。
通过气流传播到寄主上，由伤口或自然孔口侵入进行侵染。