主要在叶片和花梗上形成椭圆至纺锤形、隆起的小疮疱，中部呈桔色，周围为黄白色，有光泽。后期纵裂，周围表皮翻起，散出铁锈色粉末（夏孢子）。葱锈病是气传病害，主要危害大葱叶片、花梗及绿色茎部，影响光合作用及产量，并影响食用。发病时传播快，发病生育期多在生育后期，但危害不重。
