小麦主要病害包括锈病、白粉病、腐霉雪腐病、炭疽病、白秆病、白绢病、雪腐病、雪霉叶枯病、秆枯病、纹枯病、全蚀病、根腐病、黑穗病、秆黑粉病、赤霉病、蜜穗病、颖枯病、黑颖病、病毒病、类菌原体病、粒瘿线虫病、禾谷胞囊线虫病和根结线虫病等。麦类虫害有管蓟马、麦二叉蚜、麦长管蚜、黍蚜、麦双尾蚜、玉米蚜、麦秆蝇、麦种蝇、麦黑斑潜叶蝇、大螟、吸浆虫、麦圆蜘蛛、麦长腿蜘蛛、叶蜂、皮蓟马、麦茎蜂、麦田棉铃虫和粘虫等。
