辣椒脐腐病主要发生在果实落花部位周围,初期表现为暗绿色或深灰色水渍状病斑,随后扩展为直径2-3厘米的病斑。随着果实发育,病斑变为灰褐色或白色扁平凹陷状,通常从果实尖部向中部蔓延,可影响半个果实。病果常提前变红,一般不腐烂。在潮湿环境下,病果可能被真菌腐生,但即使腐烂也无臭味。果实顶部(脐部)呈水浸状,病部暗绿色或深灰色,迅速变为暗褐色,果肉失水,顶部凹陷。