茄子灰霉病主要危害叶片、花朵以及果实。叶片染病时，多在叶面或叶缘产生近圆形至不规则形或“V”形病斑，斑上有深浅相间的轮纹，湿度大时生有灰褐色霉层。茎干染病初期为褐色水渍状病斑，严重时可扩展至绕茎一周，湿度大时生有灰色霉层。花器染病多出现在柱头或花瓣边缘。
果实发病时，先侵染蒂部残存的花瓣或脐部残留柱头，之后逐渐向果面或果柄发展，形成幼果软腐，最终果实脱落或失水僵化。湿度大时，病部产生大量灰色霉层。幼果果蒂周围局部先产生水浸状褐色病斑，扩大后呈暗褐色，凹陷腐烂，表面产生不规则轮状灰色霉状物，失去食用价值。肉质根染病多在根头部形成不规则形或圆形稍凹陷黑斑，严重时病斑扩展，深达内部，使肉质根变黑腐烂。果实染病症状表现为腐烂，湿度高时有白色霉状物出现。