果实被害多从果柄开始向果实蔓延。病部灰白色至淡黄色，斑面长出白色菌丝及黑色菌核，病果软腐。茎部染病，灰白色，稍凹陷，后期表皮纵裂，病斑大小、形状、长短不等，边缘水渍状，表面和病茎内均生有白色菌丝及黑色菌核。叶片多从叶缘开始，初呈水浸状，暗绿色，无一定形病斑，潮湿时长出白霉，后期叶片灰褐色枯死。
番茄叶片染病始于叶缘，呈水浸状，淡绿色，湿度大时长出少量白霉，病斑呈灰褐色，蔓延速度较快，导致叶片枯死。
西红柿叶片多从叶缘开始，初呈水浸状，暗绿色，无一定形病斑，潮湿时长出白霉，后期叶片灰褐色枯死。
叶、果实、茎等部位均可被侵染。叶片染病始于叶缘，初呈水浸状，淡绿色，湿度大时长出少量白霉，病斑呈灰褐色，蔓延速度快，致叶枯死；果实及果柄染病，始于果柄，并向果面蔓延，致未成熟果实似水烫过，菌核外生在果实上，大小1—5毫米；花托上的病斑环状，包围果柄周围；茎染病多由叶柄基部侵入，病斑灰白色稍凹陷，后期表皮纵裂，边缘水渍状，病斑长达抹高的4/5。除在茎表面形成菌核外，剥开茎部，可发现大量菌核，严重时值抹枯死。
番茄菌核病与灰霉病的发病条件类似，危害部位也差不多，主要危害果实、茎秆、叶片等部位。1、果实。主要从果柄处或者残花处侵染，逐渐侵染到整个果面，导致果面灰白色似开水烫过，果面上生有白色霉层，中后期形成黑色菌核；2、茎秆。主要从叶柄基部入侵茎秆，在茎秆上出现灰白色凹陷病斑，表皮失水破裂，有白色霉层，中后期在茎秆表面以及茎秆内部出现黑色菌核，严重者导致死棵。另外也可以侵染果柄和叶缘，湿度大的情况下，都能形成白色浓密的霉层。
本病主要为害保护地的番茄果实，叶片和茎也被害。果实被害多从果柄开始向果实蔓延。病部灰白色至淡黄色，斑面长出白色菌丝及黑色菌核，病果软腐。茎部染病，灰白色，稍凹陷，后期表皮纵裂，病斑大小、形状、长短不等，边缘水渍状，表面和病茎内均生有白色菌丝及黑色菌核。叶片多从叶缘开始，初呈水浸状，暗绿色，无一定形病斑，潮湿时长出白霉，后期叶片灰褐色枯死。
其病部灰白色至淡黄色，斑面长出白色菌丝及黑色菌核，病果软腐。