小麦条锈病主要发生在叶片上，其次是叶鞘和茎秆及穗部。苗期染病，叶片上产生多层轮状排列的鲜黄色夏孢子堆。
初期在病部出现褪绿斑点，以后形成鲜黄色的粉疱，即夏孢子堆。夏孢子堆较小，长椭圆形，与叶脉平行排列成条状。后期长出黑色、狭长形、埋伏于表皮下的条状疱斑，即冬孢子堆。
