病菌在土壤中越冬，随流水传播。土壤低温、高湿有利发病。发病条件：田间25～30℃，相对湿度高于85%发病重。一般雨季或大雨后天气突然转晴，气温急剧上升，病害易流行。土壤湿度95%以上，持续4～6小时，病菌即完成侵染，2～3天就可完成一代。易积水的菜地，定植过密，通风透光不良发病重。
西葫芦绵腐病属真菌性病害。病菌在基质中越冬，通过茎、叶和果实表皮侵入植株，借助雨水、灌溉或管理操作等进行传播。在基质温度低、湿度大的条件下最易发病。阴雨天、露水未落干时整枝打权，虫伤多发病重。连作地、前茬病重、土壤存菌多、地势低洼积水、排水不良、土质黏重、土壤偏酸、氮肥施用过多、植株生长过嫩、虫伤多，易发病。栽培过密、株间通风透光差，种子带菌，育苗用的营养土带菌，有机肥没有充分腐熟、带菌，高温、高湿、多雨、大水漫灌，虫害发生严重，易发病。