物理防治：选择抗病害能力强的品种。在心叶期和心叶末期分别摘下病叶，每次摘两片，对其有一定的防治效果。药剂防治：播种时用专门的药剂拌种。发病时用多井悬浮液、菌核净、井冈霉素、退菌特等药剂进行防治。
玉米纹枯病属于土传病害，以菌核遗留在土壤中，和以菌丝、菌核在病残体上越冬。菌核萌发产生菌丝或以病株上存活的菌丝接触寄主茎基部而入侵，表面形成病斑后，病菌气生菌丝伸长，向上部叶鞘发展，病菌常透过叶鞘而为害茎秆，形成下陷的黑色斑块。湿度大时，病斑长出许多白霉状菌丝和担孢子。担孢子借风力传播造成再次侵染。病菌可通过表皮、气孔和自然孔口三种途径侵入寄主，其中以表皮直接侵入为主。
菌核萌发产生菌丝或以病株上存活的菌丝接触寄主茎基部表面引起发病。
玉米纹枯病侵染途径是：病菌以菌丝和菌核在病残体或在土壤中越冬。翌春条件适宜，菌核萌发产生菌丝侵入寄主，后病部产生气生菌丝，在病组织附近不断扩展。菌丝体侵入玉米表皮组织时产生侵入结构。接种6天后，菌丝体沿表皮细胞连接处纵向扩展，随即纵、横、斜向分枝，菌丝顶端变粗，生出侧枝缠绕成团，紧贴寄主组织表面形成侵染垫和附着胞。
玉米纹枯病浸染途径属于土传病害，以菌核遗留在土壤中，和以菌丝体、菌核在病残体上越冬。
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