秋西葫芦的主要病害有白粉病、病毒病和灰霉病。白粉病可用5%上格叶秀2000倍液，或40%倾城4000倍液，或用10%世高水分散粒剂1200倍液，或喷洒40%福星8000～10000倍液喷雾防治；病毒病可用20%病毒A可湿性粉剂500倍液喷雾防治；灰霉病可用50%速克灵，或50%扑海因1000倍液喷雾防治。秋西葫芦的主要害虫有蚜虫和飞虱等，可用一遍净1500倍液喷雾防治。选择抗病品种，施足底肥，加强肥水管理，对症下药进行防治。
